会查重，论文脚注会参与正文检测，会和正文一起查重。如果是word版本，脚注的标注位置比较关键，必须加在标点符号前面，不管对于句话还是引号，脚注都要加在标点符号的前面，这部分内容就不会被标红或者标黄。如果是PDF版本，脚注部分知网都无法正确的进行识别，从而会把脚注内容当作正文内容进行查重而被标红，所以建议PDF的版本转换成word版本。
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