在学术研究的世界里，论文的原创性和诚信问题一直是备受关注的话题。而随着学术不端行为的不断曝光，对于论文的查重技术也日益受到重视。在本文中，我们将探讨为什么第二次查重会出现99%的相似度，并从多个角度对这一问题进行分析。

首先，我们需要明确查重的基本原理。查重软件通过比对论文与数据库中的已存在文献，找出相似度高的内容，从而判断论文的原创性。然而，每个查重软件的算法和数据库都可能存在差异，因此两次查重的结果可能会有所不同。

当第二次查重出现99%的相似度时，可能存在以下几种情况：

1、第一次查重后，学生未对相似度高的部分进行修改，导致第二次查重时相似度仍然很高。

2、学生在第一次查重后，对相似度高的部分进行了简单修改，但修改后的内容与原有内容仍然存在很高的相似度。

3、学生使用了不规范的引用或标注方式，导致查重软件无法正确识别和剔除参考文献。

4、查重软件本身存在一定局限性，无法完全准确地识别和剔除参考文献。

针对以上情况，我们应该采取以下措施来降低查重率：

1、对相似度高的部分进行认真修改，避免简单地替换词汇或调整句子结构。

2、正确引用和标注参考文献，遵循学术规范和标准。

3、尽量避免抄袭行为，尊重和保护他人的知识产权。

4、选择可靠的查重软件，并正确使用其功能。

最后，我们应当始终牢记学术诚信的重要性。学术研究需要诚实、客观、公正的态度在撰写论文时，我们应遵守各种规范和标准正确地引用和标注参考文献诚实地撰写论文是每个学者和学生的基本义务。只有当我们以诚信的态度对待学术研究论文写作及查重过程中相似度过高的现象会逐渐减少直至消失进而营造出一个更加公平、公正、透明的学术环境。