本科论文查重是会查重目录的，目录也是在论文的正文部分，但是只要目录的格式设置正确，知网查重系统就会自动识别出目录部分，并不会将目录部分计算到重复率之中。并且在本科论文完成的时候，也是需要将目录放入本科论文中，以达到完整性的目的。本科论文的目录格式可以使用word工具进行自动插入即可，不需要学生手动设置目录的格式。
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