知网会查重pdf版的参考文献内容，参考文献属于论文中的一部分，所以用户上传论文时，知网查重系统也会对参考文献部分进行查重，查重系统如果识别出了正确的引用格式，并且文献内容和数据库中收录的一致，那么知网查重系统在查重文献时不会将文献的内容计算到重复率之中，对此，用户只要设置了正确的引用格式，并且不修改引用文献内容即可。
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